2002年,邵芸在古装历史喜剧《大脚马皇后》中饰演小宋敬妃。
2007,参演由张国立、陈建斌主演的亲情剧《亲兄热弟》。此后,她还与斯琴高娃、蒋雯丽、吕丽萍、王志文等多位演员有过合作。
2016年5月16日,邵芸主演的黑色荒诞喜剧网络电影《莞城夜未眠》在视频网站上线,她在剧中饰演了纯真俏皮又有些迷糊的柳青青。9月,出演悬疑犯罪电影《荼蘼杀机》,在剧中分别饰演时而柔弱善良的尚南与阴鸷癫狂的尚北;随后,邵芸出席首届绿氧电影季颁奖典礼,并凭借该片获得金槿奖最佳女主角。12月21日,其主演的科幻动作网络电影《梦魇行者》上线,她在剧中饰演了一个能够清晰得记住梦境的女孩姚小沫。同年,她出演由郭靖宇执导的年代剧《娘道》,在剧中饰演腹黑又柔弱的念娣。
2017年6月,邵芸与叫兽易小星领衔主演都市奇幻网络喜剧《万能图书馆》,在剧中饰演表面争强好胜、爱面子,实则内心善良的图书馆馆长张一蕾。